Для корректного ответа необходимо вопросу придать параметры. Что именно имеете в виду, какая цена покупки, сколько своих денег, планируете использовать кредитные средства, прочее? Например, исключается прямой перевод средств материнского капитала по чужому долгу, в том числе по чужому кредитному договору, ибо маткап перечисляют по кредиту владельца сертификата, его супруга. Второй вариант - это прямой перевод собственнику имущества, но для начала необходимо погасить кредит и снять обременение ипотеки в силу закона, иначе, никак. Есть возможность оформить ипотеку в том же банке, купить квартиру с использованием кредитных средств, а потом сделать частичное или полное погашение кредита маткапом. Возможно, чтобы в ДКП маткап фигурировал, как первоначальный взнос де-юре, а де-факто, перевод денег позже, после запроса банком в ПФР или личного обращения с предоставлением соответствующей справки с банка и так далее, тому подобное. Сценариев развития несколько, исходя из возможностей покупателя в первую очередь, а в некоторых случаях, воли сторон сделки и лояльности банка.

Здравствуйте, Арман дал довольно развернутый ответ, полностью поддерживаю слова, надо понимать как Вы будете приобретать и в качестве какой оплаты Вы подразумеваете использование средств МК.

можно.
более подробно вам нужно консультироваться в конкретном банке, у которого в залоге находится квартира

Можно, но осторожно.